1998年，根据国发96号文件精神，汪水明校长创建了这所教育体制改革初中试验校。创建初期，学校空楼一座，荒草一片。由于体改校办学经费自筹，经纶人白手起家，凭着创业者的精神，硬是将当年黄土露天、满目萧然的操场和徒有四壁的教学楼建设成为今天这绿茵环绕、一步一景、现代化教学设施一应俱全的一座花园式学校。给学生创造了学习、生活、发展的良好空间。这期间，学校的固定资产增长了6.75倍。全校从初的8个教学班，扩充到18个、32个，高达到44个教学班；学生从400多名到2000多名；教职员工从24名到150多名；教育教学稳步发展，办学质量逐年提高。
　　2010年1月，学校从体制改革试验校转为公办校。学校由原来的一个校区增加为两个校区——东湖湾校区和原南湖东园校区，办学规模进一步扩大。转公办之前，陈经纶分校可以自主招生，学生压力比较大但教学质量也很高。转为公办校之后，生源质量受到一些影响，所以2013年的中考成绩变成了检验陈分转公办后学校实力的一个重要标准。