北京市第三十九中学是一所历史悠久的普通完全中学。其前身是光华女中、耕莘中学（两所寄宿制教会学校），1952 年由北京市人民政府接管后，正式命名为北京市第三十九中学。80年的历史积淀，使学校有着优良的教育传统，多年来为国家培养了数以万计的人才。
　　北京市第三十九中学现校舍，是近年内市区两级政府投资9千万元，于2002年8月建成的一个以六层教学大楼为主立体建筑的新校舍，总占地面积约1.3万平方米，主体建筑的使用面积 18000 m2，可容纳32个教学班，内有化学实验室、物理实验室、生物实验室各3个，总面积900平方米。计算机房、美术、音乐、历史、地理、观摩、多媒体等专用教室10个，总的面积950 m2。楼内设有图书馆350 m2、阅览室300m2 教师电子备课室、学生电视台、多功能厅、报告大厅、形体健身房、体育馆、游泳馆，及可供全校师生千人用餐的食堂。院内有4749 m2环形塑胶跑道，人工草皮操场和998 m2羽毛场，与六层教学大楼竟相辉映，气派非凡。