北京市六五中学始建于1870年，由美国基督教长老会创办，原名“崇慈女子中学校”，是京城一所有百年历史的老校。1952年9月，正式由人民政府接管，改名为“北京市第十一女子中学”。1972年，改名为“北京市六五中学”。　　改革开放以来，我校更加重视学生的综合素质培养。20世纪90年代，马岳东校长即提出了“面向全体，不失一人；五育并举，五育齐抓；不拘一格，广育人才”的办学方针。进入21世纪，关宏杰校长又提出了“创建一支结构合理，爱岗敬业，务实求真，有较高水平和凝聚力的教职工队伍；建设一个有浓厚校园文化氛围，校风优良、管理科学、讲实效、有特色、开放式、学习型，社会声誉较高的优质完全中学”的发展目标。2007年，单志敏校长又在新一轮课程改革和学习型组织建设的基础上明确提出了“让每一位教师都获得专业化发展，让每一名学生都健康成长”的办学目标。　　我校管理严格，校风良好，教学秩序井然，在“全纳教育”理论指导下，以“随班读”工作为龙头，面向全体，关注差异，全面推动学校教育教学工作，各方面工作都在扎实前进，学生在德、智、体等方面获得了较为全面的发展。　　近几年，我校先后被评为“北京市健康促进学校”、“北京市文明礼仪示范校”、“北京市随班读工作学校”、“首都军（警）民共建单位”、“北京市科技事业档案工作目标管理市级”、“北京市节水型单位”、“北京市敬老文明模范学校”、“东城区艺术教育特色学校”等，获得2008-2009学年度东城区教育系统综合评价特等奖、“首都国庆60周年群众游行”组织单位、“北京市特殊教育工作集体”、“东城区数独比赛集体一等奖”等荣誉。