农产品加工与核农技术研究所由1986年成立的农畜产品贮藏加工研究所和1980年成立的原子能农业应用研究所合并而成，是以从事农产品贮藏加工和核技术农业应用为主的综合型科研机构。
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该所下设办公室、科研与产业管理科、计划财务科3个行政科室和粮食与果蔬加工、畜禽与水产品加工、功能食品和核农技术4个研究室和1个辐照。现有在职职工51名，各类专业技术人员40人，具有中、职称31人，其中博士6人，硕士13人，研究员3人，享受政府津贴人员1人。湖北省农业科技创新农产品加工分挂靠在该所，农产品加工分包括农产品加工与核农技术2个创新团队，进入创新岗位的科技人员有14人。同时，该所还是国家农产品加工技术研发食用菌专业分依托单位。
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新建的5987平方米的实验大楼于2009年1月投入使用，农产品加工实验室拥有180多台套仪器设备，5吨高低温冷库1座，设计建设装源容量为50万居里的钴60辐照装置一座，具备辐照剂量检测和微生物检测条件。辐照开展了医疗用品及药品辐射消毒，食品辐照贮存保鲜，化妆品，商品与文物标本养护，高分子材料改性，农作物辐射育种及农产品辐照贮存保鲜等方面的应用，已为省内外100多家企业辐照加工产品200余种，取得了良好的社会和经济效益。
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建所以来，主要开展了淡水鱼保鲜加工、果蔬保鲜加工、功能食品、辐射加工、食用菌加工、食品安全、辐照加工技术等方面的科研工作；先后主持和参加国家、省部级等研发项目60多项，是“十一五”与“十二五”国家农业部公益性行业专项华中地区主持单位，“十一五”国家自然科学基金项目、科技部国际合作与交流重大项目主持单位。建所以来，共取得各类科研成果71项，其中获奖励13项；获省级科技成果奖18项；获得国家授权专利12项，发布国家标准2项，在国内外学术刊物上发表论文350多篇，编写著作4部。