华南环境科学研究所成立于1973年，是环境保护部直属的从事综合性环境科学研究的公益性科研机构。研究所位于广州市天河区员村西街七号大院。
我所科学城项目占地50亩，总建筑面积近1.8万平方米，目前已进入全面施工阶段，预计在2012年5月可以建成投入运行。科学城项目的建设为我所长远发展提供了基础和空间，也为解决干部职工的生活和工作问题提供了条件。
华南环境科学研究所作为国家驻南方的综合环境科研机构，以热带亚热带区域环境问题研究，经济特区、沿海开发区、大城市与特大城市群和港澳台等发达地区环境问题研究，河口、感潮河网、海洋等复杂水环境模拟研究，区域、流域可持续发展研究，污染控制方法创新研究等为主要研究方向。近年来，为适应我国新时期的环保需求，我所重新整合队伍，发挥已有的学科优势，在环境战略、环境规划方法、城市环境问题、近岸海域环境问题、污染水环境生态修复、水环境污染控制技术、大气同步脱硫除氮技术、环境信息技术等研究领域展开攻关，逐步形成了新的学科优势。向国家和地方提供了管理决策和污染技术支持，取得了多方面的成绩。
华南环境科学研究所一贯秉承“科研先行，服务并重”的发展理念，不断推进科研成果转化，依托科研支撑，提高环境咨询和环境工程服务水平，打造了“层次高、实力强、质量优”的行业服务品牌，在华南地区享有很高的声誉。拥有各类级别高的环境专业资格证书，涵盖环境影响评价、环境规划、工程咨询、工程设计、工程总承包、环保设施运营、水土保持方案编制、水资源论证、清洁生产审计、上市公司环保核查、环保验收、环境监理、进口废物风险评价、环保产品质检、室内空气质量检测、科技成果检测等业务。
建所三十余年，承担了国家及广东等沿海地区大量的环境科研任务，多项成果达到国内甚国际，获得国家科技进步奖5项，部、省、市各级科技进步奖及其它奖励100余项。华南科学研究所现有省部级实验室3个。