良渚中学创建于1958年，原是一所局属普通中学，1983年9月改建成余杭县农技中学，1988年初中部从农技中学分离出来，改为良渚一中。学校分别于2002年和2008年与大陆中学、安溪中学合并、搬迁，更名为良渚镇中学，2011年复名为良渚中学。

余杭区良渚中学座落于依山傍水、风景秀丽的良渚街道荀山村，与良渚文化村隔河相望，与美丽洲公园紧密相连。学校占地130亩，建筑面积为39000平方米，绿化面积为27000平方米，学校有400米塑胶跑道、体育馆、阶梯教室等设施，所有教室均安装多媒体设备，音、美、劳、电脑等教室以及物理、化学、生物实验室等均达到省级一类配备。

目前学校有教学班37个，学生1358人，教职工163人，其中职称教师40人，中级职称教师67人。教师中有杭州市教坛新秀、区学科带头人、青年教师岗位能手、区级以上骨干教师等40余人。为打造城乡教育共同体，提升教育品质，实现资源共享、互助共赢，学校与杭州市朝晖中学（浙工大附中）结成友好学校。

学校是“良渚文化宣传基地”、杭州市安全文明单位、杭州市红十字示范学校、杭州市中小学示范实验室学校、余杭区文明单位、余杭区绿色学校，2003年学校被评为杭州市示范初中，2005年学校被评为浙江省示范初中，2009年学校荣获世界卫生组织浙江省合作“健康促进学校省级银奖”。