南京百院教育研究所始建于2003年，其前身南京创新教育科学研究，是由高等教育工作者和高等教育机构联合申请，经南京市科学技术委员会批准成立的区域性研究高等教育科学的民办非企业单位。2006年5月22日经国家行政主管部门批准成立：南京百院教育发展研究所。研究所办公地址设在江苏省社会科学院。
南京百院教育发展研究所响应党、国务院关于扩大高等教育招生规模的决策及千方百计助学业的方针,坚持高校毕业生业制度的改革方向,联袂百（万）所高等教育机构共同打造中国教育阳光工程平台；坚持走出去与请进来相结合、与研究人员相结合、理论研究与实践创新想结合的原则；坚持以教育资源平衡研究为主，从事教育资源的研究、开发、推广，提供教育信息咨询、培训服务；坚持以科学发展观为统领，与时俱进，广泛吸收国内外教育新研究成果，虚心向国内外典型学习，在自主的基础上，开放合作式发展空间,启用实用出色的运营模式以及技术特色，走研学产相结合的发展道路，推动了教育研究、教育资源平衡在教育服务业的狂飙发展。南京百院研究所现已形成以高、中等院校需求导向，以调查研究、开发优质教育资源和推广教育项目为特色，集教育科研、信用助学、人才培养、产业研发为一体的综合性、多功能的发展格局和生长形态。是国内关注中国教育资源平衡及高等教育招生政策变化的非官方教育研究机构。在新的发展时期，南京百院教育教育研究所正以高度的责任感、崭新的姿态、扎实的研究，与时俱进，开拓创新，为中国教育资源平衡和建设创新型教育和和谐社会而迎接新的挑战！
南京百院教育发展研究所通过研究机制改革创新、优化与完善，打造了一支勇于探索、锐意创新、充满活力的团队，现有专职人员26人，另外还聘请了一批兼职研究员。我们长期拥有一支近万名在校大学生组成的高素质招生咨询志愿者团队，并聘请了众多知名教授、高校招办老师等组成的教育咨询团。全所实行所长负责制。
百院宗旨：
以马列主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想为根本方针，贯彻落实科学发展观，贯彻党和国家的教育方针和“百花齐放、百家争鸣”方针，遵守宪法、法律、法规和国家政策，开展基础教育、高等教育信用助学的理论与实际问题的研究，总结经验，探索规律，为基础教育、高等教育的改革与发展服务。倡导教育经纪，引导教育消费，服务现代教育，服务广大求学者。

百院职能：
百院主要职能为基础教育教学业务管理、高等教育科学发展研究、信用助学研究、高校毕业生业指导： 一、高等教育科学研究、教育课题的开发、推广；
二、高等教育形象设计策划及开展教育文化经纪系列服务； 三、各类学历提升；职业技能培训、取证； 四、响应国家有关精神：探讨开发公益事业、发展研究信用助学、落实下岗创业及社会再业精神、为大学生勤工助学与社会实践及社会再业人员提供帮助；
五、上级主管机关赋予研究所其它社会职能。