横溪中学地处江宁区南部横山抗日老区，创办于1958年8月，校址在横溪镇北面的荒山坡上，初占地面积2690平方米。建校初期条件艰苦，仅有两个班级来自横溪、丹阳、铜山及临近的安徽村镇的120名学生，4名教师，4间教室，师生同吃同住同劳动。

1959年9月，黄高年任副校长主持学校工作。1960年学校规模扩大到6个班级，学生345名，教职工20余人，校舍面积953平方米，学校占地总面积16765平方米。

三年经济困难时期，流生多，为了“大办农业”，下放了部分超龄学生，1962年继续贯彻以“调整”为的八字方针，学校有5名教师下放小学，有一名职员下放回家。1963年，学校对教师提出了“五认真”要求，组织教师文化进修，开展教研活动，努力提高教师文化和业务水平。

1965，程兆祥任副校长主持工作。1966年月，程兆祥调出，黄高年回校任副校长。同年社教工作队进驻学校，开展“四清”运动。1966年“”开始，学校正常的教育教学工作陷于停顿。1968年3月学校复课闹革命，学生回校，解放军进驻学校，成立“横溪中学革命委员会”，侍继慰任革委会副主任。同年横溪初级中学更名为横溪中学。

1966—1968年三界初中毕业生同时毕业。1969年，学校开始办高中（学生来自横溪、丹阳、陶吴、铜山四个公社的初中毕业生）招高一和初一新生各一个班，共110人。“文革期间”，学校盖了礼堂、饭厅、厨房，新建一幢750平方米的教学楼，还办了当时全县大的木材加工厂。

1975年，横溪乡在红杨、安民、上庄、官塘、横岗5所小学内开设初中班，时称“戴帽子初中班”

1976年10月，学校步入稳定发展期。1977年，学校占地面积增加到26531平方米，校舍面积增加到2497平方米，初高中各6各班，学生671名，教职工41人。

1979年9月，张从兴任副校长兼支部书记。1980年，学校停招高中新生，校名恢复慰“横溪初级中学”。学校筑起围墙，建立了门卫。学校发展到13个班（包括一个“五、七”班）；先后制定了学校管理细则和各种规章制度，鼓励教师进修，教学质量不断提高；学校注重加强对学生美育和劳技教育，指导学生种菜、育桂花、广玉兰和雪松等，经济和知识技能双丰收。1983年，学校被评为县“两个文明建设集体”。

1984年9月，宜乐任副校长主持工作，张从兴任支部书记。改造平房1260平方米，建成横溪乡试验楼和教职工住宿楼（全县农村初中）各一幢。还创办了桑蚕和化工两届职高班。

1987年9月，宜乐任校长兼支部书记，李军任副校长。先后创办了玻璃钢装潢厂和塑料加工厂。建校舍6间，1988年撤并红旗联中，班级增加到18个，一千多名学生，百名教职工。

1994年9月，兵任副校长。同年撤并了呈村联中，学校占地面积增加到30997平方米。1995年，建成教学楼两幢（连廊式），建筑面积2204平方米；平整了大操场；修筑了200米环形跑道；建立了卫生室、图书室和阅览室；并联营办了皮鞋厂，改善了办学条件和教职工生活。

1995—1998年，连续四年办了化工、机械、机电、市场营销职业班，为地方经济培养了一批人才。随着改革深入，学校先后修订和完善了教育教学各项岗位责任制和考核制度，学校管理逐步走向制度化、规范化。教学工作注重学生的全面发展，体育和劳技教育已形成学校特色。教学质量稳中有升，中考成绩一直居陶吴片水平，1997年中考成绩排名全县14位。1991粘合1997年两次被评为县党支部；1995年被教育局评为集体，1996年被评为县“劳技学校”。
?改革促发展，1998年起县政府提出高质量实施义务教育，乡政府加大投入，改造校舍及内部设施，2000年4月通过省教育现代化合格乡镇验收；2002年12月创建成为江苏省示范初中，同年被评为区级教学工作集体。这一年正是在校学生数达到顶峰时期，拥有32个班级1864名学生，110多名教职工。

2003年10月，陈全福任校长，缪献政任副校长。同年抗击“非典”之后，学校安全工作已列为重中之重，层层建立责任状。由于工作到位，措施有力，2005年被评为“安全工作单位”；2005年底完成“六有”工程改造工作；2006年被市教育局和环保局评为“绿色学校”；同年在“合格学校”达标验收时，区教育局和镇政府投入近百万元资金，更新学生课桌椅800套，教师办公桌椅90套，增添了体育器材、电脑、食堂餐具、理化生实验仪器等，改善了办学条件，提升了教学质量，2006年中考成绩全区排名第八位。2005年2006年连续两年获区教学质量优胜奖。

为了进一步贯彻落实义务教育，从2007年起免受了学生学杂费，2008年起又免受书本费，费用由政府承担。2007年底，政府对学校发展重新定位，作出异地新建重大举措，投资2500万元高起点建造南京市农村初级中学学校，2008年初破土动工，年底竣工。巨大投入迎来可喜回报，2008年中考成绩又获全区第八位。