南京旭东中学创建于1996年7月。初是由南化公司职工子女总校负责，委托当时的省级中学——南化一中管理的校内初中民办班，取名为“宏志班”。招收学生为南化职工的子女，自愿报名即可录取。教学模式大特色是英语分小班实验教学。选派总校内的骨干教师担任班主任及各门教学管理工作。建班两年后，因管理教学到位，办学理念，原中等生源的学生在各类学科竞赛活动中表现出众，成绩优异，受到家长的好评。不久，“宏志班”在本地区名声大振，慕名而来的学生越来越多。到1999年，班级由原来的2个班逐步发展扩大到初中3个年级12个班级，成为一所较为正规的学校。2000年7月，由总校上报，经南京市教育局审核、批准，宣布该校正式。校部社在大厂葛关路80号（原南化总校办公大楼处）。首任校长为刘成烈老师。学校也正式挂牌，被命名为“南京民办旭东中学”。“旭东”二字含义深刻“一是她本身为南化公司总校创建，而南化公司的创办人即知名的化工企业家范旭东先生，区此名可纪念这位为南化做出贡献的名人；二是旭日东升象征着希望、朝气、兴旺，寓意下一代像初升的太阳，充满朝气，茁壮成长。希望学校的发展前景辉煌发达。十年创业，不负众望。在全校员工的共同努力、奋力拼搏下，业绩斐然。从1999年开始，历年中考，在南京十几所民办中学中名列前茅，为南京市省级高中培养了一批批品学兼优的人才，赢得了家长和学生的普遍赞誉，在本地区初级中学中，占有重要地位。2006年学校规模再次扩大，因原来校园狭小，迁入新校区开始新的发展。