南京市江宁实验小学创建于1929年，是江苏省首批省级实验小学。始为初级小学，只有十几个学生，1名教师。1933年，江宁县为自治实验县，该初级小学定名为江宁自治实验县土山镇实验小学。次年，该校有6个教学班（包括骆村一个分部），200多名学生，十几名教师。开设1个小单班（从一四年级各抽10名学生组成），进行四复式教学实验，供各小学参观仿效。"九·一八"事变后，该校大唱抗日歌曲，在校园设置"国耻地图"（用砖嵌地面为国界、省界，用木牌标示列强侵占中国的地域或签订的不平等条约，上方斜坡上镶嵌出"还我河山"四个大字），有时邀请东北流亡青年来校作报告，控诉日军的暴行。

　　抗日战争时期，实验小学惨遭日本侵略军破坏。汪伪时期改名为"模范小学"，进行奴化教育，虽开设有5个班级，但只有百名学生，七八个教员。抗日战争胜利后，该校又改名为东山镇国民小学，直解放前夕只有4个班级、195名学生和6名教师，而且校舍年久失修，课桌凳残缺不全。

　　从解放到1956年秋，该校已有14个班级（其中6个低年级是二部制），709名学生，22名教师，学龄儿童入学率达85%以上。1957年初，东山镇小学改名为江宁县实验小学，组建了1个单班（一四年级）控索农村复式教学的路子。1959年下半年，增设生产劳动课，并发动各学科教师自己动手制作教具，有的教具图形为省编自然教科书选作插图。1960年上半年1963年上半年，省委批准实验小学为小学五年一贯制试点校，适当缩短年限，适当提高程度，适当控制学时，适当增加劳动。

　　""开始，江宁县实验小学被斥为"黑样板"，并改名为东山镇小学，教学工作受到严重影响。1978年，该校被确定为县属小学，次年5月又恢复校名为江宁县实验小学。1980年8月被确定为全省95所实验小学之一。

　　由于江宁县撤县建区，2001年9月学校更名为南京市江宁实验小学。

　　学校积极响应区委区政府的"三校联动"号召，2004年7月2005年8月学校分两次搬迁新校址，并合并了原东山镇第三小学。目前学校占地面积92亩，校园北依东山、草坪绿篱、环境优美。有市、区学科带头人、教学标兵49名，本科学历教师50人，受区以上表彰达107人次。

　　学校坚持以创建"实验型、示范型、高质量、有特色"的省内名校为办学目标，以"为学生一生的发展奠基"为工作指南，深入实施素质教育。学校拥有整套现代化的教育技术装备，每个教室、办公室及专用教室均可通入宽带接入Internet网。

　　近几年来，学校获得省级以上奖项达580多项，现为江苏省教育科学研究基地，省心理教育实验学校、省现代教育技术实验学校，省体育传统项目学校、省美术教育科研基地、南京市艺术教育特色学校、市基础教育课程改革实验基地。学校以出色的党建工作赢得市教育工委基层党组织、市教育系统党建工作创新奖、基层党支部的光荣称号，其中党建工作创新事迹在市教育局党建工作会议上交流。学校少先队先后被授予"全国红旗大队""省功勋大队"称号。

　　现在，在校长李洪祥同志的带领下，全校教职员工深入开掘江宁实小百年名校的文化底蕴和优良传统，发扬"领导呕心沥血艰苦奋斗;教师心无旁骛一心上进;学校响鼓重擂名声在外"的作风和特点，重塑学校精神和价值观，使敬业爱生、积极进取、勤勉负责成为学校的主流文化，以"时不我待、舍我其谁"的志向和决心争做名师，打造实小品牌，全面发展学生，全面推进学校新一轮发展的进程，落实素质教育，力争使学校早日成为市内、全省的新实小。