我校的源头为二十世纪50年代初期创办的南京市上新河中学和80年代创办的南京市南湖一中两校的高中部。1995年，南京市区划调整，上新河中学由雨花台区划归建邺区。翌年2003年，区委区政府把南京市第五中学与上新河中学高中部整合，报市政府批准，上新河中学为江苏省中学南京市第五中学的寄宿制高中分校。南湖一中于1985年创立，1988年设立高中部，2000年被评为市。2003年，其高中部迁南苑。2004年，南京市又一次区划调整时，第五中学划出建邺区；南湖一中高、初中剥离，成立南湖中学，原五中上新河分校成为其分校区。同年，被评为江苏省三高中。05、06连续两年被南京市教育局授予教学推进奖。

随着南京市河西建邺新城的蔚然崛起，迅猛发展，建邺区委区政府为落实“科教兴区”的战略，开创河西教育高起点的新局面，实现建成“文化大区”的目标，对两校高中部优质资源进一步整合，完全合并，报经市政府批准，于2007年4月18日正式揭牌命名为南京市建邺中学。同年被评为江苏省四高中。

追溯校史，半个多世纪的艰苦奋斗、敬业奉献，张扬深厚的爱生情怀，春风化雨育芳菲；乘改革开放之春风，开拓进取，绽放富有生命力之花，不断发展。两校已为社会主义建设事业输送了数以万计的合格劳动者，其中拔乎其萃者，有分别在部委、地方各级政府部门、军队、高校、文艺界等任职的，今仍兢兢业业地在其岗位上为祖国贡献力量。

看今朝，团结、务实、奋进的领导班子继往开来，与时俱进，聚两家“三风”建设之精粹，汇两家办学理念之底蕴，秉持“精粹精进，向善向上”的精神，以精细化的管理理念，全力创建“特色鲜明，质量”的精品高中。教师严谨治学，已形成“求真、求活、精益求精”的教风。建邺中学正全力打造精品形象，谱写精美华章，在新的征途上直挂云帆济沧海，信心百倍地向着胜利的彼岸远航。

58届陈先安江苏省监狱管理局副局长[1]

60届斐德义，江苏省音乐家协会副主席，国家一级演员

61届成正和，中国作家协会会员，江苏知名作家

63届单泰裕南京轻型飞机股份有限公司副总经理

63届吴冬华曾任无锡市市长、中共扬州市委书记、现任江苏省政协副主席　　　　63届肖奚安解放军理工大学理学院数学系著名教授

73届钟沛南京市企业改革先行者，现任上海淮海商业（集团）有限公司总经理

73届李吉平六合区区委副书记

70年代丁应通雨花台区板桥新城副总指挥

74届曾菱红河海大学教授硕士生导师

74届史先荣下关区区委常委副区长

76届黄海华南京军区空军副大队长，获得飞行“银质”奖章

80届俊明曾任中国注美国休斯敦总领事馆副领事、中国注荷兰大使馆一等秘书现任国务院科技部人事司副司长

80届钱趋程南京荣成化工有限公司总经理

84届霍慧萍秦淮区区委常委副区长

84届朱毅建邺区法制办公室主任

85届刘莅建邺区委办公室主任

96届过玉宾现为江苏舜天足球队主力队员

99届丁培在校期间发明的“伞具抗风减压装置”获全国发明、一等奖

章震宇现任职国家第十四研究所摄影师江苏省美术家协会会员中国国画家协会会员中国书画研究院画家南京市摄影家协会会员[2]