南通电子口岸有限公司成立于2013年6月，注册资本500万人民币，是经南通市人民政府批准成立，由南通市政府、南通市商务局、南通市财政局、南通海关、南通出入境检验检疫局、南通海事局、南通边防检查站、南京海关数据分、南通出口加工区物流有限公司和南通港口集团等多家单位出资出力、联合组建的企业。公司按照“政府扶持、企业运作”的运营模式，以信息化技术为手段，通过整合口岸资源，全力打造“大通关、大口岸、大物流、大商贸”的口岸公共信息化平台，实现企业通关更加、有序、便捷，口岸综合执法和服务能力显著提升，为改善南通对外贸易环境、提升城市经济软实力注入新的活力。