上海市脑血管病研究所是隶属于上海科学院的全额拨款事业单位，于1997年3月14日组建，是从事脑血管病的专业研究机构。主要成员经历了国家“八五”、“十五”、“十一五”攻关、国家自然科学基金、上海市科委重大项目、上海市政府重大专项基金和多项上海市科技发展基金等中风预防重大项目的研究。目前正承担国家“十二五”攻关课题研究，并在中风预防研究领域取得了一系列重大的科研成果，曾经获得国家科技进步二、三等奖和上海市技术进步奖。
研究所现有员工26名，其中具有职称7人，中级职称12人。专业科室设有中风社区预防、新药开发和生物工程研究室。多年来，研究所一直致力于脑血管病的高危预防策略研究，建立了以脑血流动力学检测为主要手段的中风预警软件，研制开发出中风药物及其系列产品，总结出有效、可行的中风高危个体筛查与干预管理方案。尤其在中风预警领域具有明显的优势，所建立的筛查工具敏感度达到80％以上。在“中风高危人群筛查与干预管理”一级预防策略研究中取得了重要进展。项目主要成果连续三个五年计划被纳入国家攻关课题的验证性研究，中风高危个体筛查与干预管理方案被遴选为国家攻关课题社区脑卒中预防与控制的适宜技术。项目研究工作受到国家科技部、卫生部和上海市科委的高度关注和大力支持。
现因承接国家“十二五”科技攻关支撑计划扩展性研究项目“脑卒中高危个体筛查与干预管理”，进一步开展示范社区脑卒中高危人群早期识别和干预技术的研究工作，将在全国筛选确定的各级医疗机构多地开展该项目。同时作为全国脑血管病研究办公室、中国健康促进基金会、中国老年保健医学研究会等部门共同发起的“脑卒中早期预警与脑血管健康管理”项目的技术支持单位，将于2014年在全国大型三甲医院合作建立20家脑血管健康管理；并计划在今后五年内实施“十、百、千”计划，在全国建立1000家以上脑血管健康管理。