紫光电子所隶属的紫光集团，前身是成立于1988年7月的清华大学科技开发总公司, 是经原国家教委批准, 由清华大学主办,
全民所有制的科技先导型校办企业集团。
1993年4月, 清华大学科技开发总公司改组成立清华紫光(集团)总公司, 主办单位仍为清华大学。
清华控股有限公司成立后, 紫光集团的股权全部划拨清华控股有限公司,清华控股有限公司成为紫光集团的全资控股股东。
截2007年12月31日, 紫光集团总资产为13.6亿元, 合并营业收入为6.7亿元, 是清华控股有限公司下属的企业之一。
北京清华紫光电子公司，成立于1992年8月，为清华紫光集团公司的全资下属公司，在集团公司的领导下，通过不懈努力，
公司从中关村一家不知名的小公司发展成长为国内知名的IT企业。深圳市紫光平安技术有限公司是紫光电子在深圳的机构。