同济大学和重庆市政府于2017年联合成立了同济大学重庆研究院及运营平台重庆同济研究院有限公司。双方在人才交流合作、创新平台建设、关键共性技术研发、科技成果应用转化及产业化、高科技企业孵化和战略研究咨询等方面开展合作。同济大学重庆研究院由同济大学工程与产业研究院管理，聚集整合同济大学的科研成果、人才团队等资源，围绕重庆市支柱和新兴产业，结合重庆企业实际需求，实现技术产业化和成果市场化，通过市场运营推进科技成果转移转化和开发各类新产品，五年内孵化10到20家高科技企业，努力培育上市公司。同时，重庆研究院打造创新研发平台，提高同济大学科技成果转化能力和科技、人才服务社会的能力。重庆研究院依托同济大学现有优势科研基地平台，主要围绕生态环保、新能源汽车、装备制造、新材料、生物制药、智慧城市等领域，实现科技成果转化。研究院一期落户于重庆市两江新区互联网学院，工作地点主要为重庆。