一、主要职能
　　市区各分局、专业局的职能按省局批准的征管改革方案要求配置。
　　二、机构设置
(一)市区分局机构设置
　　1、科室的设置
(1)保留办公室、人事监察科、综合业务科。
(2)将稽查科（稽查务所）更名为收评估科。
　　(3)撤销计划财务科；计财科原有财务职能划归办公室，收计划、财务审计工作划归综合业务科，源管理工作划归管理性质的务所。
调整后市区分局内设行政科室为：办公室、人事监察科、综合业务科、收评估科等4个科室。
　　2、务所的设置
　　(1)跨行政区划（街道）、按专业化征管职能设立的务所，在务所前冠以顺序号数字，取消按务所承担的职能命名的做法；郊区按行政区划设置、执行属地征管原则的务所，在务所前冠以所在地行政区划的地名。
　　(2)江北征收管理务所、城东征收管理务所的功能仍按现行模式；人、财、物和机构（包括文明创建）由属地分局管理，征管业务接受征管局领导，考核由属地分局负责。
　　(3)江北征收管理务所迁移高新分局，11月1日起在新址办理江北3区的收征管工作；从现在起江北所的人、财、物整体冻结，其机构改革（指人员政策性分流和自愿分流）在浦口分局实施。
　　(4)控制务所的人数规模，以15人左右为宜，一般不设10人以下的务所；特殊情况，需经市局研究批准。
3、市区分局内设科室、务所的职能划分按照深化市区征管改革方案要求另行核定。
(二)专业局机构设置
1、涉外收管理分局（涉外收管理处）内设机构设置为：办公室、人事监察科、综合业务科、收评估科、国际收调查科、务所、第二务所等7个科(室)所。
　　2、进出口收管理分局（进出口收管理处）内设机构设置为：办公室、综合业务科、申报科、审核科、检查科等5个科。
　３、稽查局内设机构设置为：办公室、人事监察科、稽查管理科、案源管理科、案件审理科、协查科、综合业务科、收评估科等8个科室和、二、三、四、五、六等6个务所。共14个科(室)所。务违法案件举报不单列机构，可与案源管理科或协查科合署办公。
　　４、征收管理局内设机构设置为：办公室、人事监察科、综合业务科、稽核评科、登记管理务所、征收务所、发管理务所、第二发管理务所等8个科(室)所。
　　5、专业局内设科室、务所的职能划分按照深化市区征管改革方案要求另行核定。
　　三、人员编制和领导职数
　　市区分局(局)行政编制和事业编制控编数另行核定。
　　领导职数为：局长1名，副局长2名；内设科(室)所领导职数根据所设科(室)所的数量及人数设置（见《南京市国家务局系统定编定岗实施办法》）。
市区分局(局)科级非领导职数按有关规定配置。宁国函〔2002〕135号关于印发《南京市国家务局沿江工业开发区分局职能配置、机构设置
和人员编制方案》的通知