学校位于阜南县城焦阳北路，创建于1988年。学校占地30000平方米，有教学楼4幢，科技楼1幢，办公楼1幢，学生宿舍楼1幢，教工宿舍4幢。由高规模的微机室两个、多媒体教室，文印室、档案室等。有占地10000平方米的操场一个。校内景点多处，园内繁华似景，绿草如茵。运动场地30亩，运动设施齐备。

阜南二中建校以来，确立了“负重拼搏、深化改革、自我加压、争创”的指导思想，制定了“四个一”工作要求，即一个能者上庸者下的用人原则，一个提高教学质量的教学，一项双向选择的改革措施，一个争创四个(的管理、的教师、的学生、的质量)的战略目标，加强治安管理，强化育人手段，壮大育人队伍，优化校风学风，从而提高了教学质量，加快了学校的发展。

该校由建校时的一个教学班36名学生的初级中学，发展为24个教学班230名学生的完全中学，在职教师146名。1992年以来，为大专院校和阜阳一中、阜南一中高中部输送合格新生206名，为社会培养“四有”新人2316名，走出了一条独具特色的办学之路。

阜南二中创办于1988年8月，1992年开始设立高中部，成为一所完全中学。

目前2004年5月，由于教育教学等方面成绩突出，被批准为阜阳市示范中学。阜南二中是阜阳市市级示范高中，市级"语言文字规范化示范校"、市级"花园式学校"、省级"爱国主义教育示范学校"、"读书育人特色学校"。06年市级示范高中办学水平督导评估验收中被评为。